Bibliographie

2022


  • Larmarange Joseph (2022) Ggstats: Extension to 'ggplot2' for Plotting Stats, version 0.1.0. https://CRAN.R-project.org/package=ggstats.
    Résumé : Provides suite of functions to plot regression model coefficients ("forest plots"). The suite also includes new statistics to compute proportions, weighted mean and cross-tabulation statistics, as well as new geometries to add alternative background color to a plot.

  • Larmarange Joseph (2022) « Santé sexuelle des HSH et des TS à l'international » (communication orale (session plénière), présenté à 23e Congrès de la Société Française de Lutte contre le Sida, Paris. https://congres-sfls.fr/.

  • Larmarange Joseph (2022) « Autodépistage du VIH en Afrique de l’Ouest : programme ATLAS, premier bilan et quelles suites » (communication orale), présenté à 16e journées scientifiques IMEA IRD SPILF, Paris. https://www.imea.fr/.

  • Larmarange Joseph (2022) Ggstats: Extension to 'ggplot2' for Plotting Stats, version 0.1.1. https://CRAN.R-project.org/package=ggstats.
    Résumé : Provides suite of functions to plot regression model coefficients ("forest plots"). The suite also includes new statistics to compute proportions, weighted mean and cross-tabulation statistics, as well as new geometries to add alternative background color to a plot.

  • Larmarange Joseph (2022) « Autodépistage du VIH en Afrique de l’Ouest : recherches et leçons apprises du projet ATLAS en Côte d'Ivoire, Mali et Sénégal » (communication orale (webinaire), présenté à Webinar QuanTIM, Marseille. https://hal.ird.fr/ird-03907553.
    Résumé : Le programme ATLAS, coordonné par un symposium Solthis / IRD et financé par Unitaid, a visé la promotion et le déploiement de l'autodépistage du VIH (ADVIH) en Afrique de l'Ouest. Il a été mis en oeuvre entre 2019 et 2021 en Côte d'Ivoire, au Mali et au Sénégal avec les ministères de la santé des trois pays et une trentaines de partenaires. Près de 400 000 autotests ont été distribués par plus de 1400 agents formés (pairs-éducateurs et soignants). Les autotests de dépistage peuvent être remis aux personnes pour leur propre usage (distribution primaire) ou pour qu'elles les redistribuent à leurs partenaires et connaissances (distribution secondaire). Compte tenu du contexte épidémiologique ouest-africain (épidémies mixtes), ATLAS a intégré la distribution secondaire comme une composante cruciale. L'objectif de la distribution secondaire est de fournir l’ADVIH au-delà des contacts primaires atteints par les professionnels de la santé et les pairs éducateurs lors de la distribution primaire. Ces contacts secondaires sont souvent des membres des populations clés qui sont plus difficiles à engager dans la prévention du VIH, ainsi que d'autres populations vulnérables périphériques. Cette spécificité de l’ADVIH implique que les bénéficiaires (utilisateurs finaux) de l’ADVIH ne sont pas limités aux contacts primaires. Plusieurs volets de recherche en vue d'une évolution multidimensionnelle ont été menés dans ATLAS (enquêtes qualitatives, enquête par téléphone auprès des utilisatrices et utilisateurs, recueil des coûts, modélisation épidémiologique). Dans cette présentation, nous présenterons les principaux résultats de recherche et montrerons que la distribution secondaire est faisable, acceptable, coût-efficace et permets d'atteindre, au-delà des populations clés, des populations vulnérables qui n'avaient pas/peu accès au dépistage du VIH.

  • Larmarange Joseph (2022) « Atteindre les populations périphériques en Afrique de l’Ouest : autodépistage du VIH et distribution secondaire »Fabiana Cazzorla, Bulletin du CLiSP #47. https://clisp.fr/2022/06/22/bulletin-47-juin-2022/.
  • Larmarange Joseph et équipe ATLAS (2022) « Autodépistage du VIH en Afrique de l’Ouest : Synthèse des résultats des recherches menées dans ATLAS » (communication orale (symposium ATLAS), présenté à AFRAVIH, Marseille.

  • Paré Caroline (2022) « Lutte contre le SIDA: les projets de recherche de l’ANRS à l’international », Priorité santé, Radio France Internatinal. https://www.rfi.fr/fr/podcasts/priorit%C3%A9-sant%C3%A9/20221129-lutte-contre-le-sida-les-projets-de-recherche-de-l-anrs-%C3%A0-l-international.
    Résumé : À deux jours de la Journée mondiale du SIDA du 1er décembre, nous donnons la parole à des chercheurs et des acteurs de terrain, mobilisés pour lutter contre la maladie. Le VIH touche environ 38,4 millions…


  • Mohareb Amir M, Larmarange Joseph, Kim Arthur Y, Coffie Patrick A, Kouamé Menan Gérard, Boyd Anders, Freedberg Kenneth A et Hyle Emily P (2022) « Risks and benefits of oral HIV pre-exposure prophylaxis for people with chronic hepatitis B », The Lancet HIV (juillet 8). DOI : 10.1016/S2352-3018(22)00123-0. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352301822001230.
    Résumé : Individuals with chronic hepatitis B virus (HBV) infection who are at substantial risk of HIV acquisition benefit from pre-exposure prophylaxis (PrEP) with tenofovir-based antiviral therapy. Considering that tenofovir potently inhibits HBV, providing PrEP to individuals with HBV effectively results in treatment of their HBV infection. However, some clinicians might be hesitant to initiate PrEP in people with chronic HBV due to unknown risks of HBV reactivation, hepatitis, and acute liver failure during periods of antiviral cessation. Unfortunately, these knowledge gaps affect scale up of PrEP among people with chronic HBV. Emerging data regarding the risks and benefits of antiviral cessation in people with chronic HBV suggest that PrEP can be safely initiated despite the risks of non-adherence or discontinuation. People with chronic HBV who stop PrEP should be closely monitored for HBV reactivation and hepatitis flares after antiviral cessation.


  • Nouaman Marcellin N., Becquet Valentine, Plazy Mélanie, Coffie Patrick A., Zébago Clémence, Montoyo Alice, Anoma Camille, Eholié Serge, Dabis François, Larmarange Joseph et for the ANRS 12361 PrEP-CI Study Group (2022) « Incidence of HIV infection and associated factors among female sex workers in Côte d’Ivoire, results of the ANRS 12361 PrEP-CI study using recent infection assays », PLOS ONE, 17 (11) (novembre 17), p. e0271988. DOI : 10.1371/journal.pone.0271988. https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0271988.
    Résumé : Background This study aimed to estimate, using an HIV Recent Infection Testing Algorithm (RITA), the HIV incidence and its associated factors among female sex workers (FSW) in Côte d’Ivoire. Methods A cross-sectional study was conducted in 2016–2017 in Abidjan and San Pedro’s region among FSW aged ≥ 18 years. In addition, a sociodemographic questionnaire, HIV screening was carried out by two rapid tests. In the event of a positive result, a dried blood spot sample was taken to determine, using a RITA adapted to the Ivorian context, if it was a recent HIV infection. Results A total of 1000 FSW were surveyed with a median age of 25 years (interquartile range: 21–29 years). 39 (3.9%) tested positive for HIV. The incidence of HIV was estimated to be 2.3 per 100 person-years, with higher incidence rates among those 24 years old or less (3.0% vs. 1.9%), non-Ivorian FSW (3.2% vs. 1.9%) and those with the lowest education level (4.6% in FSW who never went to school vs. 2.6%). The incidence seemed to be associated with the sex work practice conditions: higher incidence among FSW whose usual price was less than 3.50$ (4.3% vs.1.0%), FSW who had a larger number of clients on the last day of work (6.1% in those with 7 clients or more vs. 1.8%), FSW who reported not always using condoms with their clients (8.5% vs. 1.5%) and FSW who reported agreeing to sex without a condom in exchange for a large sum of money (10.1% vs. 1.2%). Conclusion This study confirms that FSW remain highly exposed to HIV infection. Exposure to HIV is also clearly associated with certain sex-work factors and the material conditions of sex work. Efforts in the fight against HIV infection must be intensified to reduce new infections among FSW.
    Mots-clés : Epidemiology, HIV, HIV epidemiology, HIV infections, Medical risk factors, Sex work, Sexually transmitted diseases, Virus testing.

  • Nouaman Marcellin, Coffie Patrick A, Plazy Mélanie, Becquet Valentine, Agoua Aline, Zébago Clémence, Dao Hervé, Larmarange Joseph, Eholié Serge et ANRS 12381 PRINCESSE study group (2022) « Prevalence and incidence of sexually transmitted infections in a cohort of female sex workers in San Pedro, Côte d'Ivoire (ANRS 12381 PRINCESSE) » (poster), présenté à 24th International AIDS Conference, Montreal. https://programme.aids2022.org/Abstract/Abstract/?abstractid=6713.
    Résumé : BACKGROUND: The ANRS 12381 PRINCESSE study is an interventional single-arm cohort. Participants recruitment started in November 2019. The study aimed to evaluate a comprehensive and community-based care offer among FSWs aged '¥ 18 years in the San Pedro area. METHODS: Care services included quarterly syndromic screening for STIs, as well as vaginal and anal swabs for the screening of chlamydia trachomatis (CT) and neisseria gonorrhoea (NG) by polymerase chain reaction (PCR) at M0, M12 and M24. At the same visits, identification of dysplasias and precancerous lesions of the cervix was performed by visual inspection after applying acetic acid and Lugol's iodine. STIs were managed according to the national algorithm. We describe (i) the characteristics of cervical lesions as well as the prevalence of STIs (syndromic and PCR) and associated symptoms and (ii) the incidence of syndromic STIs during follow-up. RESULTS: In November 2021, 372 FSWs were included. The median age was 29 years, 34% had never been to school, 56% were Ivorian, and the median duration of sex work was 2 years. At inclusion, 4.7% [95% confidence interval: 2.8-7.5] had cervical lesions with 3.5% leukoplakia and 2.2% haemorrhagic cervical junction zone. The prevalence of syndromic STIs was 17.2% [13.0-22.6]; associated clinical signs were vaginal discharge (13.7%), vaginal ulceration (2.1%), lower abdominal pain (4.3%) and cervical inflammation (2.6%). The prevalence of anovaginal CT and NG were 8.7% [6.2- 12.1] and 10.4% [7.6- 13.9], respectively; clinical signs were found in 2.4% of CT-positive and 12.2% of NG-positive FSWs. Most FSWs with syndromic STIs did not have CT or NG infection. During the follow-up, 82 cases of syndromic STIs were observed per 209 person-years, i.e. an incidence of 39.1% [31.1- 49.0]. PCR data at M12 and M24 are being consolidated and will allow estimating the incidence of CT and NG. CONCLUSIONS: A high prevalence and incidence of syndromic STIs were observed among FSWs, highlighting the importance and the interest of a regular follow-up. The results also showed the predominantly asymptomatic nature of STIs discovered by PCR in this at-risk population and, therefore, the importance of coupling syndromic screening and PCR analyses.
  • Nouaman Marcellin, Coffie Patrick, Plazy Mélanie, Becquet Valentine, Agoua Aline, Zebago Clémence, Zonhoulou Dao Hervé, Eholie Serge, Larmarange Joseph et ANRS 12381 PRINCESSE study group (2022) « Prévalence et incidence des infections sexuellement transmissibles dans une cohorte de travailleuses du sexe à San Pedro, Côte d’Ivoire (Projet ANRS 12381 Princesse) » (communication orale #CO5.3), présenté à AFRAVIH, Marseille.
    Résumé : Objectifs Estimer la prévalence et l’incidence des infections sexuellement transmissibles (IST) chez des travailleuses du sexe (TS) en Côte d’Ivoire Matériels et Méthodes Le projet ANRS 12381 Princesse est une cohorte interventionnelle mono-bras, dont les inclusions ont débuté le 26/11/2019 visant à évaluer une offre de soins globale et communautaire auprès des TS de ≥ 18 ans dans la région de San Pedro. L’offre de soins comprend un dépistage syndromique trimestriel des IST, ainsi que des prélèvements vaginaux et anaux à la recherche de chlamydia trachomatis (CT) et de neisseria gonorrhée (NG) par polymerase chain reaction (PCR) réalisés à M0, M12 et M24. A ces mêmes visites, la recherche de lésions dysplasiques et/ou précancéreuses du col de l’utérus est effectuée par inspection visuelle après application d’acide acétique et de Lugol. En cas de diagnostic positif, les TS sont prises en charge selon l’algorithme national ou référées en cas de complications. Nous décrivons ici i) les caractéristiques des lésions du col ainsi que la prévalence des IST (syndromiques et par PCR) et des symptômes associés et ii) l’incidence des IST syndromiques au cours du suivi. Résultats Au 27/11 2021, 372 TS étaient incluses. L’âge médian était de 29 ans (Intervalle interquartile (IIQ) : 24 – 35), 125 (33,6%) n’avaient jamais été scolarisées, 210 (56,0%) étaient ivoiriennes et l’ancienneté médiane dans le travail de sexe de 2ans (IIQ= 0 – 5). A l’inclusion, 4,7% [Intervalle de confiance à 95% : 2,8- 7,5] présentaient des lésions du col avec 3,5% de leucoplasies et 2,2% de zone de jonction du col hémorragique. La prévalence des IST syndromiques était de 17,2% [13,0 - 22,6] ; les signes cliniques associés étaient des écoulement vaginaux (13,7%), des ulcérations vaginales (2,1%), des douleurs abdominales basses (4,3%) et l’inflammation du col de l’utérus (2,6%). Les prévalences de CT et de NG ano-vaginales étaient respectivement de 8,7% [6,2- 12,1], et 10.4% [7,6- 13,9] ; la présence de signes cliniques a été retrouvée chez 2,4% des TS diagnostiquée positives au CT et chez 12,2% chez celles positives à NG. La majorité des TS avec une IST syndromique n’avaient pas d’infection à CT ni à NG. Au cours du suivi, 82 cas d’IST syndromiques ont été observés pour 209 personnes-année, soit une incidence de 39,1% [31,1- 49,0]. Les données PCR à M12 et M 24 sont en cours de consolidation et permettront l’estimation des incidences respectives de CT et NG début 2022. Conclusion Cette étude montre une prévalence élevée et une forte incidence des IST syndromiques parmi les TS de la cohorte Princesse, soulignant l’importance et l’intérêt d’un suivi régulier. Les résultats montrent également le caractère majoritairement asymptomatique des IST découvertes par PCR dans cette population à risque, et donc l’importance de coupler le dépistage syndromique et les analyses de PCR.

  • Plazy Mélanie, Nouaman Marcellin, Becquet Valentine, Agoua Aline, Zébago Clémence, Dao Hervé, Coffie Patrick A, Eholié Serge, Larmarange Joseph et ANRS 12381 PRINCESSE study group (2022) « Delays to PrEP initiation among female sex workers in Côte d'Ivoire (ANRS 12381 PRINCESSE project) » (poster), présenté à 24th International AIDS Conference, Montreal. https://programme.aids2022.org/Abstract/Abstract/?abstractid=6824.
    Résumé : BACKGROUND: To describe the delays to initiation of oral pre-exposure prophylaxis (PrEP) among female sex workers (FSW) in Côte d''Ivoire. METHODS: The ANRS 12381 PRINCESSE project is a single-arm interventional cohort aiming to evaluate the implementation of a comprehensive and community-based care offer among FSW aged '¥18 years in the San Pedro region since end-2019, through a mobile clinic operating on 10 prostitution sites (visited every two weeks). PrEP is offered to all HIV-positive FSW after verifying the creatinine level (results valid for one month). We described the time between FSW's interest for PrEP and PrEP initiation (or end of follow-up) among HIV- and hepatitis B virus-negative (HBsAg-) FSW included until end-October 2021. The probability of PrEP initiation since PrEP interest is described through a Kaplan-Meier curve censored on end-November 2021 (an analysis censored at the date of the last visit was also conducted). RESULTS: Of the 362 FSW included in the PRINCESSE cohort, 302 were HIV-/AgHBs-, and for 296 of them, PrEP was presented by medical staff (95.2% at inclusion). In total, 292 FSW expressed PrEP interest, and 192 (65.8%) initiated PrEP: 18 on the same day (the biological test having been performed during a previous visit), 148 during the next visit (median time since interest: 3 weeks [Inter-Quartile Range: 2-6]) and 26 during a subsequent visit (median time: 20 weeks [9-36]). The probability of PrEP initiation after PrEP interest was 39.0% at 1 month and 56.6% at 3 months (censoring on the date of the last visit, these proportions were 50.7% and 74.6%, respectively). Among the 100 FSW who did not initiate PrEP despite expressing interest, 68 were never seen again in the project; 4 declared that they were no longer interested in PrEP (median time since interest: 12 weeks [10-19]), 1 was tested HIV+ (delay of 2 weeks), and 27 were seen >1 month later (their biological tests were no longer valid). CONCLUSIONS: Despite strong PrEP interest among FSW, PrEP initiation remained suboptimal. Barriers to PrEP initiation should be more explored and considered to find appropriate solutions to make PrEP effective among this specific key population.
  • Plazy Mélanie, Nouaman Marcellin, Becquet Valentine, Agoua Aline, Zebago Clémence, Zonhoulou Dao Hervé, Coffie Patrick, Eholie Serge, Larmarange Joseph et ANRS 12381 PRINCESSE Study Team (2022) « Retards et obstacles à l’initiation de la PrEP orale chez les travailleuses du sexe en Côte d’Ivoire (projet ANRS 12381 PRINCESSE) » (poster #PJ181), présenté à AFRAVIH, Marseille.
    Résumé : Objectifs Décrire les retards et obstacles à l’initiation de la prophylaxie pre-exposition (PrEP) orale des travailleuses du sexe (TS) en Côte d’Ivoire. Matériels et Méthodes Le projet ANRS 12381 PRINCESSE est une cohorte interventionnelle mono-bras, dont les inclusions ont débuté le 26/11/2019, qui vise à évaluer la mise en oeuvre d’une offre de soins globale et communautaire auprès des TS de ≥18 ans dans la région de San Pedro. Il s’organise autour d’une clinique mobile se déplaçant sur 10 sites prostitutionnels (chaque site étant visité toutes les deux semaines) et d’une clinique fixe. La PrEP est proposée à toutes les TS VIH- ; l’initiation est possible après vérification du taux de créatinine (déterminé via un bilan biologique ; résultats valables un mois). L’analyse présentée se limite aux TS VIH- et séronégatives au virus de l’hépatite B (AgHBs-) incluses jusqu’au 30/09/21, et décrit ce qu’il s’est passé entre l’intérêt exprimé pour la PrEP et la prescription de la PrEP (ou la fin de suivi). La probabilité d’initiation de la PrEP après avoir exprimé son intérêt est décrite via une courbe de Kaplan-Meier censurée au 23/11/21 (une analyse censurée à la date de dernière visite a aussi été conduite). Résultats Parmi les 362 TS étaient incluses dans la cohorte PRINCESSE, 302 étaient VIH-/AgHBs-. Sur les 296 TS à qui la PrEP a été présentée (95,2% à l’inclusion), 292 se sont déclarées intéressées (99,7% le jour même). Parmi elles, 192 (65,8% des TS intéressées) ont reçu une prescription de PrEP : 18 le jour même de l’intérêt exprimé (le bilan biologique ayant été réalisé lors d’une précédente visite), 148 lors de la visite suivante (délai médian depuis l’intérêt : 3 semaines [Intervalle Inter-Quartile : 2-6]) et 26 lors d’une visite ultérieure (délai médian : 20 semaines [9-36], soit parce qu’elles n’étaient temporairement plus intéressées (n=3), soit parce qu’elles sont revenues tardivement). Au final, la probabilité de prescription de la PrEP après avoir exprimé son intérêt est de 39,0% à 1 mois et de 56,6% à 3 mois (en censurant sur la date de dernière visite, ces proportions sont respectivement de 50,7% et 74,6%). Parmi les 100 TS qui n’ont pas initié la PrEP malgré un intérêt exprimé, 68 n’ont jamais été revues dans le projet ; parmi les 32 TS qui sont revenues à au moins une deuxième visite suivant leur intérêt pour la PrEP, 4 ont déclaré ne plus être intéressées par la PrEP (délai médian depuis l’intérêt : 12 semaines [10-19]), 1 a été dépistée VIH+ (délai de 2 semaines) et 27 sont revenues plus d’un mois après (leur bilan biologique n’était plus valable). Conclusion Malgré un fort intérêt exprimé pour la PrEP, son initiation reste sous-optimale parmi les TS de PRINCESSE. Les premières analyses exploratoires et discussions avec les équipes terrain suggèrent plusieurs obstacles (mobilité des TS, intérêt mal perçu pour la PrEP, lourdeur du suivi, fidélité des sorties de la clinique mobile), et confirment la nécessité de trouver des solutions adaptées pour rendre la PrEP effective chez les TS.

  • Rouveau Nicolas, Ky-Zerbo Odette, Boye Sokhna, Simo Fotso Arlette, d'Elbée Marc, Maheu-Giroux Mathieu, Silhol Romain, Kouassi Arsène Kra, Vautier Anthony, Doumenc-Aïdara Clémence, Breton Guillaume, Keita Abdelaye, Ehui Eboi, Ndour Cheick Tidiane, Boilly Marie-Claude, Terris-Prestholt Fern, Pourette Dolorès, Desclaux Alice, Larmarange Joseph et pour l'équipe ATLAS (2022) Décrire, analyser et comprendre les effets de l’introduction de l’autodépistage du VIH en Afrique de l’Ouest à travers l’exemple du programme ATLAS en Côte d’Ivoire, au Mali et au Sénégal, Working Papers du CEPED (52), Paris : Ceped, 26 p. https://www.ceped.org/wp.
    Résumé : Ce working paper est une traduction en français de l’article suivant : Rouveau N, Ky-Zerbo O, Boye S, Simo Fotso A, d’Elbée M, Maheu-Giroux M, Silhol R, Kouassi AK, Vautier A, Doumenc-Aïdara C, Breton G, Keita A, Ehui E, Ndour CT, Boilly MC, Terris-Prestholt F, Pourette D, Desclaux A, Larmarange J for the ATLAS Team. Describing, analysing and understanding the effects of the introduction of HIV self-testing in West Africa through the ATLAS programme in Côte d’Ivoire, Mali and Senegal. BMC Public Health. 2021, 21, 181. doi.org/10.1186/s12889-021-10212-1 Contexte : Le programme ATLAS vise à promouvoir et à déployer l’autodépistage du VIH (ADVIH) dans trois pays d’Afrique de l’Ouest : Côte d’Ivoire, Mali et Sénégal. Sur la période 2019-2021, en étroite collaboration avec les parte-naires nationaux de mise en œuvre de la lutte contre le sida et les communautés, ATLAS prévoit de distribuer 500 000 kits VIHST à travers huit canaux de distribution, combinant des stratégies fixes et des stratégies avancées, une distribution primaire et une distribution secondaire d’ADVIH. Tenant compte de l’épidémiologie ouest-africaine, les cibles du programme ATLAS sont les populations difficiles à atteindre : les populations clés (travailleuses de sexe, hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes et usager·e·s de drogues), leurs clients ou partenaires sexuels, les partenaires des personnes vivant avec le VIH et les patients diagnostiqués avec des infections sexuellement transmissibles et leurs partenaires. Le programme ATLAS intégrer ainsi un volet recherche ayant pour objectif d’accompagner cette mise en œuvre et de générer des connaissances sur le passage à l’échelle de l’ADVIH en Afrique de l’Ouest. L’objectif principal est de décrire, d’analyser et de comprendre les effets sociaux, sanitaires, épidémiologiques et économiques de l’introduction de l’autodépistage du VIH en Côte d’Ivoire, au Mali et au Sénégal pour améliorer l’offre de dépistage (accessibilité, efficacité, éthique). Méthodes : La recherche ATLAS est organisée en cinq work packages (WP) multidisciplinaires : WP Populations clés : enquêtes qualitatives (entretiens individuels approfondis, discussions de groupe) menées auprès des acteurs clés, des populations clés et des utilisateurs des services de dépistage du VIH. WP Dépistage des cas index : observation ethnographique de trois services de soins VIH introduisant l’ADVIH pour le dépistage du partenaire. WP Enquête coupons : une enquête téléphonique anonyme auprès des utilisateurs de l’ADVIH. WP Volet économique : analyse des coûts économiques différentiels de chaque modèle de dispensation à l’aide d’une approche descendante avec collecte des coûts programmatiques, complété par une approche ascen-dante auprès d’un échantillon de sites de dispensations de l’ADVIH, et une étude temps-mouvement auprès d’un échantillon d’agent·e·s dispensateurs. WP Modélisation : adaptation, paramétrisation et calibration d’un modèle compartimental dynamique qui prend en compte les diverses populations ciblées par le programme ATLAS et les différentes modalités et stra-tégies de dépistage. Discussion : Le programme ATLAS est la première étude complète sur l’autodépistage du VIH en Afrique de l’Ouest. Le programme ATLAS se concentre particulièrement sur la distribution secondaire de l’ADVIH. Ce protocole a été ap-prouvé par trois comités d’éthique nationaux et par le comité d’éthique de la recherche de l’OMS. Mots-clés : VIH/SIDA, autodépistage du VIH, Afrique de l’Ouest, Sénégal, Côte d’Ivoire, Mali.


  • Sabapathy K., Balzer L., Larmarange Joseph, Block L., Floyd S., Iwuji C., Wirth K., Ayles H., Fidler S., Kamya M., Petersen M., Havlir D., Dabis F., Moore J. et Hayes R. (2022) « Achieving the UNAIDS 90–90-90 targets: a comparative analysis of four large community randomised trials delivering universal testing and treatment to reduce HIV transmission in sub-Saharan Africa », BMC Public Health, 22 (1) (décembre 13), p. 2333. DOI : 10.1186/s12889-022-14713-5. https://doi.org/10.1186/s12889-022-14713-5.
    Résumé : Four large community-randomized trials examining universal testing and treatment (UTT) to reduce HIV transmission were conducted between 2012–2018 in Botswana, Kenya, Uganda, Zambia and South Africa. In 2014, the UNAIDS 90–90-90 targets were adopted as a useful metric to monitor coverage. We systematically review the approaches used by the trials to measure intervention delivery, and estimate coverage against the 90–90-90 targets. We aim to provide in-depth understanding of the background contexts and complexities that affect estimation of population-level coverage related to the 90–90-90 targets.
    Mots-clés : Antiretroviral treatment, HIV, Treatment as Prevention, UNAIDS 90-90-90, Universal Testing and Treatment.

  • Silhol Romain, Maheu-Giroux Mathieu, Soni Nirali, Simo Fotso Arlette, Rouveau Nicolas, Vautier Anthony, Doumenc-Aïdara Clémence, N'Guessan Kouakou, Mukandavire Christinah, Vickerman Peter, Keita Abdelaye, Ndour Cheikh Tidiane, Larmarange Joseph, Boily Marie Claude et ATLAS Team (2022) « Identifying population-specific HIV diagnosis gaps in Western Africa and assessing their impact on new infections: a modelling analysis for Côte d'Ivoire, Mali and Senegal » (poster), présenté à 24th International AIDS Conference, Montreal. https://programme.aids2022.org/Abstract/Abstract/?abstractid=4243.
    Résumé : BACKGROUND: Progress towards HIV elimination in Western Africa may be hindered by diagnosis gaps among people living with HIV (PLHIV), especially among key populations (KP) such as female sex workers (FSW), their clients, and men who have sex with men (MSM). We aimed to identify largest gaps in diagnosis by risk group in Mali, Côte d'Ivoire, and Senegal, and project their contribution to new HIV infections. METHODS: Deterministic models of HIV transmission/diagnosis/treatment that incorporate HIV transmission among KP were parameterized following comprehensive country-specific reviews of demographic, behavioural, HIV and intervention data. The model was calibrated to country- and group-specific empirical outcomes such as HIV incidence/prevalence, the fractions of PLHIV ever tested, diagnosed, and on treatment. We estimated the distribution of undiagnosed PLHIV by risk group in 2020 and the population-attributable-fractions (tPAFs) (i.e. fraction of new primary and secondary HIV infections 2020-2029 originating from risk groups of undiagnosed PLHIV). RESULTS: From 46% (95% UI: 38-58) to 69% (59-79) of undiagnosed PLHIV in 2020 were males, with the lowest proportion in Mali and the highest proportion in Senegal, where 41% (28-59) of undiagnosed PLHIV were MSM. Undiagnosed men are estimated to contribute most new HIV infections occurring over 2020-2029 (Table). Undiagnosed FSW and their clients contribute substantial proportions of new HIV infections in Mali, with tPAF=20% (10-36) and tPAF=43% (26-56), respectively, while undiagnosed MSM in Senegal are estimated to contribute half of new infections. A lower proportion of new HIV infections are transmitted by undiagnosed KP in Côte d'Ivoire (tPAF=21%(10-38)). CONCLUSIONS: Current HIV testing services and approaches are leaving members of KP behind. Increasing the availability of confidential HIV testing modalities in addition to traditional tests may substantially reduce gaps in HIV diagnosis and accelerate the decrease of new HIV infections in Western Africa since half of them could be transmitted by undiagnosed KP.
  • Simo Fotso Arlette, Johnson Cheryl, Vautier Anthony, Kouame Konan Blaise, Diop Papa Moussa, Doumenc Aïdara Clémence, Baggaley Rachel, Ehui Eboi, Larmarange Joseph et équipe ATLAS (2022) « Mesure de l’impact populationnel de l’auto-dépistage du VIH par la triangulation de données programmatiques de routine : Exemple du projet ATLAS en Côte d’Ivoire » (poster #PV164), présenté à AFRAVIH, Marseille.
    Résumé : Objectifs L’auto-dépistage du VIH (ADVIH) est recommandé comme stratégie de dépistage par l’OMS. Il a pour avantage de permettre aux personnes de réaliser elles-mêmes leur test et de garantir la discrétion et confidentialité, permettant de toucher des populations non testées et difficiles à atteindre. Cependant, son caractère confidentiel et l'approche de distribution via les réseaux (ciblant les population clés et leurs proches et partenaires) rendent difficile l'estimation de l’impact de l’ADVIH au niveau populationnel. Cette étude propose un moyen de surmonter ce défi et utilise des données programmatiques de routine pour estimer indirectement les impacts du projet ATLAS sur l'accès au dépistage du VIH, le dépistage du VIH conventionnel (c'est-à-dire autre que l’ADVIH), les nouveaux diagnostics du VIH et l’initiation de traitement antirétroviral (TAR) en Côte d'Ivoire. Matériels et Méthodes Les données sur le nombre de kits d’ADVIH distribués par ATLAS proviennent des rapports des partenaires de mise en oeuvre entre le troisième trimestre (T3) de 2019 et le T1 2021. Nous utilisons également les indicateurs de routine du PEPFAR agrégées par districts sanitaires et par trimestre. Les analyses se font par une régression de séries chronologiques écologiques à l'aide de modèles mixtes linéaires. Résultats Entre T3 2019 et T1 2021, 99353 kits d’ADVIH ont été distribués par ATLAS dans les 78 districts sanitaires inclus dans l'analyse. Les résultats (tableau 1) montrent un effet négatif mais non significatif sur le volume de tests conventionnels (-195) ce qui traduirait une légère substitution entre ADVIH et test conventionnel. Malgré cela l’effet net est positif sur l’accès au dépistage : pour 1000 ADVIH distribués via ATLAS, 589 personnes supplémentaires ont eu accès au dépistage du VIH avec l’hypothèse d’un taux d'utilisation d’ADVIH (TU) de 80 % et 393 avec une hypothèse de 60%. L'effet de l’ADVIH sur le diagnostic du VIH était significatif et positif (8). Pas d’effet significatif observé sur l’initiation TAR (-2). Conclusion Nos résultats mettent en évidence qu'une stratégie de distribution de l’ADVIH basée sur les réseaux ciblant les population clés et leurs proches et partenaires augmentent l’accès au dépistage du VIH et améliore le diagnostic. La méthodologie utilisée dans cet article pourrait être reproduite dans différents contextes pour l'évaluation des programmes d’ADVIH, sans nécessité de systèmes de collecte additionnels.

  • Simo Fotso Arlette, Johnson Cheryl, Vautier Anthony, Kouamé Konan Blaise, Diop Papa Moussa, Silhol Romain, Maheu-Giroux Mathieu, Boily Marie-Claude, Rouveau Nicolas, Doumenc-Aïdara Clémence, Baggaley Rachel, Ehui Eboi, Larmarange Joseph et ATLAS Team (2022) « Estimating the impact of HIV self-testing on HIV testing services, diagnoses, and treatment initiation at the population-level with routine data: the example of the ATLAS program in Côte d'Ivoire » (poster), présenté à 24th International AIDS Conference, Montreal. https://programme.aids2022.org/Abstract/Abstract/?abstractid=5409.
    Résumé : BACKGROUND: HIV self-testing (HIVST) is a critical testing approach particularly for reaching those at HIV risk who are hesitant or unable to access existing services. While the discreet and flexible nature of HIVST is appealing to users, these features can limit the ability for programmes to monitor and estimate the population-level impacts of HIVST implementation. This study triangulates publicly available routine programme data from Côte d'Ivoire in order estimate the effects of HIVST distribution on access to testing, conventional testing (self-testing excluded), HIV diagnoses, and antiretroviral treatment (ART) initiations. METHODS: We used quarterly programmatic data (Q3-2019 to Q1-2021) from ATLAS, a project that aims to promote and implement network-based HIVST distribution in West Africa, in addition to routine HIV testing services program data obtained from the PEPFAR dashboard. We performed ecological time series regression using linear mixed-models. RESULTS: Between Q3-2019 and Q1-2021, 99,353 HIVST kits were distributed by ATLAS in 78 health districts included in the analysis. The results (Table 1) show a negative but non-significant effect of the number of ATLAS HIVST on the volume of conventional tests (-190), suggesting the possibility of a slight substitution effect. Despite this, the the beneficial effect on access to testing is significant: for each 1000 HIVST distributed via ATLAS, 390 to 590 additional HIV tests were performed if 60% to 80% of HIVST are used . The effect of HIVST on HIV diagnosis was significant and positive, with 8 additional diagnoses per 1,000 HIVST distributed. No effect of HIVST was observed on ART initiations. CONCLUSIONS: Our study provides a standard methodology for estimating the population-level impact of HIVST that can be used across countries. It shows that HIVST distribution was associated with increased access to HIV testing and diagnosis in Côte d'Ivoire. Wide-scale adoption of this method will improve HIVST data quality and inform evidence-based programming.


  • Simo Fotso Arlette, Johnson Cheryl, Vautier Anthony, Kouamé Konan Blaise, Diop Papa Moussa, Silhol Romain, Maheu-Giroux Mathieu, Boily Marie-Claude, Rouveau Nicolas, Doumenc-Aïdara Clémence, Baggaley Rachel, Ehui Eboi, Larmarange Joseph et for the ATLAS Team (2022) « Routine programmatic data show a positive population-level impact of HIV self-testing: the case of Côte d’Ivoire and implications for implementation », AIDS, 36 (13) (septembre 29), p. 1871–1879. DOI : 10.1097/QAD.0000000000003328. https://journals.lww.com/aidsonline/Fulltext/2022/11010/Routine_programmatic_data_show_a_positive.15.aspx.
    Résumé : Objectives:  We estimate the effects of ATLAS's HIV self-testing (HIVST) kit distribution on conventional HIV testing, diagnoses, and antiretroviral treatment (ART) initiations in Côte d’Ivoire. Design:  Ecological study using routinely collected HIV testing services program data. Methods:  We used the ATLAS's programmatic data recorded between the third quarter of 2019 and the first quarter of 2021, in addition to data from the President's Emergency Plan for AIDS Relief dashboard. We performed ecological time series regression using linear mixed models. Results are presented per 1000 HIVST kits distributed through ATLAS. Results:  We found a negative but nonsignificant effect of the number of ATLAS’ distributed HIVST kits on conventional testing uptake (−190 conventional tests; 95% confidence interval [CI]: −427 to 37). The relationship between the number of HIVST kits and HIV diagnoses was significant and positive (+8 diagnosis; 95% CI: 0 to 15). No effect was observed on ART initiation (−2 ART initiations; 95% CI: −8 to 5). Conclusions:  ATLAS’ HIVST kit distribution had a positive impact on HIV diagnoses. Despite the negative signal on conventional testing, even if only 20% of distributed kits are used, HIVST would increase access to testing. The methodology used in this paper offers a promising way to leverage routinely collected programmatic data to estimate the effects of HIVST kit distribution in real-world programs.


  • Simo Fotso Arlette, Kra Arsène Kouassi, Maheu-Giroux Mathieu, Boye Sokhna, d’Elbée Marc, Ky-zerbo Odette, Rouveau Nicolas, N’Guessan Noel Kouassi, Geoffroy Olivier, Vautier Anthony, Larmarange Joseph et for the ATLAS Team (2022) « Is it possible to recruit HIV self-test users for an anonymous phone-based survey using passive recruitment without financial incentives? Lessons learned from a pilot study in Côte d’Ivoire », Pilot and Feasibility Studies, 8 (4) (janvier 6), p. 1-7. DOI : 10.1186/s40814-021-00965-2. https://pilotfeasibilitystudies.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40814-021-00965-2.
    Résumé : Background:  Due to the discreet and private nature of HIV self-testing (HIVST), it is particularly challenging to moni‑tor and assess the impacts of this testing strategy. To overcome this challenge, we conducted a study in Côte d’Ivoire to characterize the profile of end users of HIVST kits distributed through the ATLAS project (AutoTest VIH, Libre d’Accéder à la connaissance de son Statut). Feasibility was assessed using a pilot phone-based survey. Methods:  The ATLAS project aims to distribute 221300 HIVST kits in Côte d’Ivoire from 2019 to 2021 through both primary (e.g., direct distribution to primary users) and secondary distribution (e.g., for partner testing). The pilot survey used a passive recruitment strategy—whereby participants voluntarily called a toll-free survey phone number—to enrol participants. The survey was promoted through a sticker on the HIVST instruction leaflet and hotline invitations and informal promotion by HIVST kit-dispensing agents. Importantly, participation was not financially incentivized, even though surveys focussed on key populations usually use incentives in this context. Results:  After a 7-month period in which 25,000 HIVST kits were distributed, only 42 questionnaires were completed. Nevertheless, the survey collected data from users receiving HIVST kits via both primary and secondary distribution (69% and 31%, respectively). Conclusion:  This paper provides guidance on how to improve the design of future surveys of this type. It discusses the need to financial incentivize participation, to reorganize the questionnaire, the importance of better informing and training stakeholders involved in the distribution of HIVST, and the use of flyers to increase the enrolment of users reached through secondary distribution.

  • Stannah James, Flores Anato Jorge Luis, Mitchell Kate M, Larmarange Joseph, Maheu-Giroux Mathieu et Boily Marie‐Claude (2022) « Improving our understanding of how structural determinants impact HIV epidemics: a scoping review of dynamic models to guide future research » (poster), présenté à 24th International AIDS Conference, Montreal. https://programme.aids2022.org/Abstract/Abstract/?abstractid=6564.
    Résumé : BACKGROUND: Dynamic models of HIV transmission have proven valuable tools for informing HIV prevention strategies. Including structural determinants in models is crucial to estimate their population-level impacts on HIV transmission and inform efforts towards HIV elimination. However, this is challenging due to a lack of coherent conceptual frameworks, limited understanding of their specific causal pathways, and few empirical estimates of their impacts on downstream mediators. METHODS: With the overarching aim to improve models, we conducted a scoping review of studies that used dynamic HIV transmission models to evaluate the impact of structural determinants. From included studies, we extracted information on the types of structural determinants and methods used to model their impacts on HIV transmission. We appraised studies on how they conceptualized structural exposures and represented their causal relationships over time within models. RESULTS: We identified 9 dynamic transmission modelling studies that incorporated structural determinants of HIV, including violence (N=3), incarceration (N=2), stigma (N=2), housing instability (N=2), migration (N=1), and education (N=1). Only one study modelled multiple determinants simultaneously. In most models, structural determinants were conceptualized using current, recent, non-recent and/or lifetime exposure categories. Modelled structural determinants largely impacted HIV transmission through mediated effects on one or more proximate risk factors, including sharing injection equipment, condom use, number of partners, and access to treatment. However, causal pathways were simplistic, with few mediators and/or lack of clear empirical justification. To measure impact, most studies simply assumed the elimination of structural determinants in counterfactual comparison scenarios. Few models included long-term and/or delayed effects of past, recurrent, or acute exposure, potentially overestimating impacts of determinants. CONCLUSIONS: Despite the importance of structural determinants for HIV prevention, methods for including them in dynamic HIV transmission models remain insufficient. Few studies have attempted to incorporate structural determinants in HIV models, and methods vary considerably. To improve inferences, models should adopt precise exposure definitions, deconstruct and estimate their complex causal pathways, and translate them into their mechanistic components. The need for development of coherent frameworks to conceptualize the synergistic interplay between strengthened empirical data analysis and the inclusion of structural determinants in dynamic models is pressing.


  • Stannah James, Soni Nirali, Lam Jin Keng Stephen, Giguère Katia, Mitchell Kate M., Kronfli Nadine, Larmarange Joseph, Moh Raoul, Nouaman Marcelin N’zebo, Kouamé Gérard Menan, Maheu-Giroux Mathieu et Boily Marie-Claude (2022) « Trends in HIV testing, the treatment cascade, and HIV incidence among men who have sex with men in Africa: A systematic review and meta-regression analysis », medRxiv. DOI : 10.1101/2022.11.14.22282329. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.11.14.22282329v1.
    Résumé : Background Gay, bisexual, and other men who have sex with men (MSM) are disproportionately affected by HIV. In Africa, MSM face structural barriers to HIV prevention and treatment including socio-economic disadvantages, stigma, and criminalization that increase their vulnerability to HIV acquisition and transmission and undermine progress towards ending AIDS. This systematic review explores progress towards increases in HIV testing, improving engagement in the HIV treatment cascade, and HIV incidence reductions among MSM in Africa. Methods We searched Embase, Medline, Global Health, Scopus, and Web of Science from January 1980-March 2022 for cross-sectional and longitudinal studies reporting HIV testing, knowledge of status, care, antiretroviral therapy (ART) use, viral suppression, and/or HIV incidence among MSM in Africa. We pooled surveys using Bayesian generalized linear mixed-effects models, used meta-regression to assess time trends, and compared HIV incidence estimates among MSM with those of all men. Findings Of 8,992 articles identified, we included 148 unique studies published from 2005-2022. HIV testing increased over time in Central/Western and Eastern Africa and in 2020, we estimate that 88% (95% credible interval (CrI) 57-97%) of MSM had tested in the past 12 months, but 66% (19-94%) of MSM living with HIV knew their HIV status, although this is probably underestimated given non-disclosure. Current ART use increased over time in Central/Western (ORyear=1.4, 95%CrI 1.1-2.0, N=8) and Eastern/Southern Africa (ORyear=1.4, 1.0-1.8, N=17) and in 2020 we estimate that 75% (18-98%) of MSM living with HIV in Africa were currently on ART. Nevertheless, we did not find strong evidence viral suppression increased, and in 2020 we estimate that only 62% (12-95%) of MSM living with HIV were virally suppressed. HIV incidence among MSM did not decrease over time (IRRyear=1.0, 0.7-1.3, N=38) and remained high in 2020 (5.4 per 100 person-years, 0.9-33.9) and substantially higher (27-150 times higher) than among all men. Interpretation No decreases in HIV incidence have been observed among MSM in Africa over time, despite some increases in HIV testing and ART use. Achieving the UNAIDS 95-95-95 targets for diagnosis, treatment, and viral suppression equitably for all requires renewed focus on this key population. Combination interventions for MSM are urgently required to reduce disparities in HIV incidence and tackle the social, structural, and behavioural factors that make MSM vulnerable to HIV acquisition. Funding US National Institutes of Health, UK Medical Research Council, Canadian Institutes of Health Research, Fonds de Recherche du Quebec - Sante.
  • Traore Métogara Mohamed, Badiane Kéba, Vautier Anthony, Simo Fotso Arlette, Kabemba Odé Kanku, Rouveau Nicolas, Maheu-Giroux Mathieu, Boilly Marie-Claude, Larmarange Joseph, Terris-Prestholt Fern, d'Elbée Marc et équipe ATLAS (2022) « Coûts unitaires de l’autodépistage et du dépistage classique du VIH dans les centres de santé publics et communautaires en Côte d’Ivoire, au Mali et au Sénégal » (poster #PJ165), présenté à AFRAVIH, Marseille.
    Résumé : Objectifs L’atteinte des « trois 95 » de l’ONUSIDA a induit l’adoption de stratégies de dépistage VIH innovantes en Afrique de l’Ouest. Le projet ATLAS déploie l’autodépistage du VIH (ADVIH) en Côte d'Ivoire (CI), au Mali (ML) et au Sénégal (SN) en stratégie avancée et fixe (Figure 1). Les stratégies fixes sont mises en oeuvre dans (i) des structures de santé fixes pour le dépistage des partenaires de personnes vivant avec le VIH (Index), et pour celui des patients ayant une Infection Sexuellement Transmissible (IST) et leurs partenaires, et (ii) dans des cliniques communautaires à destination des hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH), des travailleuses du sexe (TS) et des personnes usagères de drogues (UD). Cette étude a pour objectif d’estimer les coûts unitaires des stratégies fixes ADVIH et celui des tests de diagnostic rapide (TDR). Matériels et Méthodes L’évaluation des coûts de dispensation des ADVIH a porté sur 37 (CI=16 ; ML=11 ; SN=10) centres de santé publics et communautaires entre 2019 et 2021 suivant la perspective du fournisseur. Nous avons combiné une analyse de rapports financiers avec celle d’une collecte de coûts dans les centres complétés par des observations de sessions de dispensation ADVIH et de dépistage VIH, en excluant les coûts centraux. Résultats Au total, 16001 kits d’ADVIH (CI=9306 ; ML=3973 ; SN=2722) ont été dispensés pour 32194 TDR réalisés (CI=8213; ML=3612; SN=20369). Les coûts unitaires moyens de l’ADVIH étaient compris entre 4$ et $8 pour la Côte d’Ivoire et le Sénégal (Tableau 1). Ces coûts étaient plus élevés au Mali, entre 7$ et 26$, liés à des coûts de personnels élevés (management/administration et agents dispensateurs HSH), ainsi que de faibles volumes de kits ADVIH dispensés pour certains canaux. En Côte d'Ivoire et au Sénégal, les coûts moyens du dépistage avec TDR ont été estimés dans l’ensemble des canaux à environ 4$ par personne testée (coûts non estimés au Mali). Conclusion Dans les trois pays, les coûts moyens d’introduction des ADVIH en stratégies fixes à faible volume étaient légèrement plus élevés que ceux des TDR. L’ADVIH peut diversifier l’offre de service de dépistage au niveau des structures fixes, améliorant ainsi l’accès au dépistage des populations cibles non-atteintes par les services TDR.


  • Traoré Métogara Mohamed, Badiane Kéba, Vautier Anthony, Simo Fotso Arlette, Kanku Kabemba Odé, Rouveau Nicolas, Maheu-Giroux Mathieu, Boily Marie-Claude, Larmarange Joseph, Terris-Prestholt Fern, d’Elbée Marc et for the ATLAS Team (2022) « Economic analysis of low volume interventions using real-world data: Costs of HIV self-testing distribution and HIV testing services in west Africa from the ATLAS project », Frontiers in Health Services, 2 (juin 27), p. 886513. DOI : 10.3389/frhs.2022.886513. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/frhs.2022.886513.
    Résumé : Achieving the first 95 of the UNAIDS targets requires the implementation of innovative approaches to knowing one's HIV status. Among these innovations is the provision of HIV self-testing (HIVST) kits in west Africa by the international partner organization Solthis (IPO). In order to provide guidance for the optimal use of financial resources, this study aims to estimate the program and site level costs of dispensing HIVST as well as HIV testing services (HTS) - excluding HIVST - in health facilities in Côte d'Ivoire, Mali and Senegal as part of the ATLAS project. We estimated from the provider’s perspective, HIVST and HTS incremental costs using top-down and bottom-up costing approaches and conducted a time and motion study. We identified costs at the program level for HIVST (including IPO central costs) and at the site level for HIVST and HTS. The economic costs of distributing HIVST kits were assessed in 37 health facilities between July 2019 and March 2021 (21 months). Sensitivity analyses were also performed on unit costs to examine the robustness of our estimates related to key assumptions. In total, 16,001 HIVST kits were dispensed for 32,194 HTS sessions carried out. Program level HIVST average costs ranged $12-$286, whereas site level costs ranged $4-$26 across distribution channels and countries. Site level HTS costs ranged $7-$8 per testing session, and ranged $72-$705 per HIV diagnosis. Across countries and channels, HIVST costs were driven by personnel (27%-68%) and HIVST kits (32%-73%) costs. The drivers of HTS costs were personnel costs ranging between 65% and 71% of total costs across distribution channels and countries, followed by supplies costs between 21% and 30%. While program level HIVST average costs were high, site level HIVST average costs remained comparable to HTS costs in all countries. Health facility-based distribution channels operating at low volume exhibit high proportion of central costs which should be considered carefully for financial planning when run alongside high volumes mobile outreach distribution channels. HIVST can diversify the HIV testing offer at health facilities, thus improving access to screening for target populations not reached by HTS services.
  • Zonhoulou Dao Hervé, Agoua Aline, Zebago Clémence, Nouaman Marcellin, Coffie Patrick, Plazy Mélanie, Becquet Valentine, Larmarange Joseph et ANRS 12381 PRINCESSE study team (2022) « Défis de la prise en charge des condylomes acuminés en stratégie avancée dans une cohorte de travailleuses du sexe en Côte d’Ivoire : leçons apprises dans la cohorte ANRS 12381 Princesse » (communication orale (poster discuté #PJ101), présenté à AFRAVIH, Marseille.
    Résumé : Objectifs Les condylomes acuminés résultent d’une infection du papillomavirus humain et peuvent évoluer vers des formes graves comme des cancers. Du fait de leurs pratiques, les travailleuses du sexe (TS) y sont particulièrement exposées. Nous décrivons ici les défis d’une prise en charge des condylomes en stratégie avancée. Matériels et Méthodes Le projet Princesse est une cohorte interventionnelle avec une offre de soins élargies en santé sexuelle, incluant un dépistage et une prise en charge des infections sexuellement transmissibles (IST), pour des TS de ≥ 18 ans dans la région de San Pedro, Côte d’Ivoire. Un suivi trimestriel est proposé, disponible à la fois sur sites prostitutionnels via une clinique mobile et à la clinique fixe d’Aprosam à San Pedro. Résultats Sur 381 TS suivies entre 11/2019 et 11/2020, 11 présentaient des condylomes à l’inclusion ou lors d’une visite de suivi. Dix présentaient des condylomes très développés (multiples, volumineux, kératosiques). Toutes présentaient des condylomes au niveau pubien et vaginal. Deux TS présentaient en plus des condylomes anaux. L’âge des patientes variait entre 19 et 42 ans. L’ancienneté dans le travail du sexe était variable (entre 1 et 17 ans), mais la majorité (10) travaillait dans des maisons closes, signe d’un nombre élevé de clients. Une participante a été vue en clinique fixe. Elle a bénéficié d’un traitement local à base de podophyllotoxine pour éviter de multiples cicatrices, suivi d’une cryothérapie. Les dix autres cas ont été diagnostiqués en clinique mobile qui, pour des raisons logistiques, ne dispose pas d’un appareil de cryothérapie. Les participantes vues en cliniques mobiles ont été référées vers la clinique fixe pour une prise en charge adéquate. À ce jour, aucune ne s’y est encore présentée, malgré des relances et le constat d’une extension du nombre de condylomes lors de visites de suivi. La clinique mobile disposant d’un appareil portatif de thermoablation pour la prise en charge des dysplasies du col (un dépistage annuel étant inclus), une thermoablation des condylomes a été essayée chez 6 TS pour lesquelles les condylomes étaient de bonne taille. En effet, si les condylomes sont plus petits que la sonde d’ablation, il y a un risque d’abimer des tissus sains. Aucun effet n’a été constaté immédiatement après la pose de la sonde, ni au cours des visites de suivi. Une TS s’est plainte de douleurs et de brûlures persistantes au bout de deux semaines. Conclusion Les TS sont exposées aux condylomes ano-génitaux et le diagnostic survient à un stade avancé. C’est une population difficile à engager dans les soins et le référencement vers une clinique fixe ne fonctionne pas. Une solution de prise en charge sur site est donc essentielle. Les appareils de cryothérapie sont peu adaptés pour un camion mobile. La thermoablation ne fonctionne pas sur les condylomes. L’arrivée d’appareil portatif d’électrocoagulation pourrait être une solution. Elle sera testée en 2022 dans Princesse.

2021


  • Abo Yao, Altman Mathias, Bekelynck Anne, Dahourou Désiré, Simo Fotso Arlette, Godin Zélie, Kadio Kadidiatou, Larmarange Joseph, Sondo Apoline et Valentin Louis (2021) Connaissances, attitudes et pratiques liées à la pandémie COVID-19 des médecins au Burkina Faso Vague 2 : septembre - décembre 2020, Policy brief (2), Ouagadougou : Aphro-Cov, 6 p. https://aphro-cov.com/ressources_liste/connaissances-attitudes-et-pratiques-liees-a-la-pandemie-covid-19-des-medecins-au-burkina-faso-vague-2/.
    Résumé : CAP-CoV-BF : une enquête nationale réalisées auprès des médecins au Burkina Faso Le personnel de santé se trouve au cœur du dispositif élaboré dans le cadre de la réponse à l’épidémie de COVID-19, à la fois en tant qu’acteur essentiel du dispositif de réponse à l’épidémie, et en tant que premières personnes exposées et victimes. Il est ainsi essentiel de s’assurer de la compréhension de cette maladie (symptômes, modes de transmission, mesures de prévention, etc.) et de l’acceptabilité et de l’adaptation des médecins du Burkina Faso face aux mesures de santé publique préconisées. Cela permet d’identifier les difficultés et les barrières qu’ils rencontrent afin d’adopter les mesures de protection adéquates, proposer des interventions adaptées pour les surmonter et prioriser les messages qui leur sont destinés. L’objectif principal de cette étude est de fournir aux acteurs nationaux impliqués dans la gestion de la crise des données probantes régulières et représentatives à l’échelle nationale sur les connaissances, attitudes et pratiques des médecins au Burkina Faso. Une enquête quantitative transversale par téléphone a été mise en place auprès d’un échantillon représentatif de médecins sur l’ensemble du territoire. Une 1ère enquête a été menée en septembre 2020 (n=166) et une 2ème en décembre 2020 (n=190).

  • Abo Yao, Altman Mathias, Bekelynck Anne, Dahourou Désiré, Simo Fotso Arlette, Godin Zélie, Kadio Kadidiatou, Larmarange Joseph, Sondo Apoline et Valentin Louis (2021) Connaissances, attitudes et pratiques liées à la pandémie COVID-19 des médecins au Burkina Faso - Enquêtes 1, 2 et 3 : septembre 2020 - décembre 2020 – février 2021, Policy brief (3), Ouagadougou : Aphro-Cov, 6 p. https://aphro-cov.com/ressources_liste/enquete-cap-cov-bf-resultats-des-3-vagues-denquete-et-evolutions-observees/.
    Résumé : CAP-CoV-BF : une enquête nationale réalisées auprès des médecins au Burkina Faso Le personnel de santé se trouve au cœur du dispositif élaboré dans le cadre de la réponse à l’épidémie de COVID-19, à la fois en tant qu’acteur essentiel du dispositif de réponse à l’épidémie, et en tant que premières personnes exposées et victimes. Il est ainsi essentiel de s’assurer de la compréhension de cette maladie (symptômes, modes de transmission, mesures de prévention, etc.) et de l’acceptabilité et de l’adaptation des médecins du Burkina Faso face aux mesures de santé publique préconisées. Cela permet d’identifier les difficultés et les barrières qu’ils rencontrent afin d’adopter les mesures de protection adéquates, proposer des interventions adaptées pour les surmonter et prioriser les messages qui leur sont destinés. L’objectif principal de cette étude est de fournir aux acteurs nationaux impliqués dans la gestion de la crise des données probantes régulières et représentatives à l’échelle nationale sur les connaissances, attitudes et pratiques des médecins au Burkina Faso. Une enquête quantitative transversale par téléphone a été mise en place auprès d’un échantillon représentatif de médecins sur l’ensemble du territoire. Une 1ère enquête a été menée en septembre 2020 (n=166) et une 2ème en décembre 2020 (n=190).


  • Ante-Testard Pearl Anne, Hamidouche Mohamed, Apouey Bénédicte, Baggaley Rachel, Larmarange Joseph, Benmarhnia Tarik, Temime Laura et Jean Kévin (2021) « Understanding the pathways leading to socioeconomic inequalities in HIV testing uptake in 18 sub-Saharan African countries: a mediation analysis », medRxiv. DOI : 10.1101/2021.09.18.21263768. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.09.18.21263768v2.
    Résumé : Introduction Although socioeconomic inequalities in HIV prevention, testing and treatment services have been well documented, their drivers remain poorly understood. Understanding the different pathways between socioeconomic position and HIV testing across different countries could help designing tailored programs aimed at reducing such inequalities. Methods We analysed data from Demographic and Health Surveys conducted between 2010 and 2018 in 18 sub-Saharan African countries (Burkina Faso, Cameroon, Côte d’Ivoire, Congo DR, Ethiopia, Guinea, Kenya, Lesotho, Liberia, Malawi, Mali, Niger, Rwanda, Senegal, Sierra Leone, Tanzania, Zambia and Zimbabwe). Using a potential outcomes framework and the product method, we decomposed the total effect linking wealth and recent (< 12 months) HIV testing into i) direct effects, and ii) indirect effects, via demand-related (related to individual’s ability to perceive need for care and inclination to seek care) or supply-related (related to individual’s ability to reach, pay for and engage in health care) mediators. Multivariable gender-specific modified Poisson models were fitted to estimate proportions mediated, while accounting for exposure-mediator interaction when present. Results A total of 392,044 participants were included in the analysis. Pro-rich wealth-related inequalities were observed in a majority of countries, with nine countries with high levels of inequalities among women and 15 countries among men.The indirect effects of each mediator varied greatly across countries. The proportion mediated tended to be higher for demand-related than for supply-related mediators. For instance, among women, HIV-related knowledge was estimated to mediate up to 12.1% of inequalities in Côte d’Ivoire; this proportion was up to 31.5% for positive attitudes toward people living with HIV (PLHIV) in Senegal. For the four supply-related mediators, the proportion mediated was systematically below 7%. Similar conclusions were found when repeating analyses on men for the demand-related mediators, with higher proportions mediated by positive attitudes toward PLHIV (up to 39.9% in Senegal). Conclusions Our findings suggest that socioeconomic inequalities in HIV testing may be mediated by the demand-side more than supply-side characteristics, with important variability across countries. Overall, the important inter-country heterogeneity in pathways of socioeconomic inequalities in HIV testing illustrates that addressing inequalities requires tailored efforts as well as upstream interventions.A French version of the abstract is available upon request from the corresponding author.
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  • Barnier Julien, Briatte François et Larmarange Joseph (2021) Questionr: Functions to Make Surveys Processing Easier, version 0.7.5. https://CRAN.R-project.org/package=questionr.
    Résumé : Set of functions to make the processing and analysis of surveys easier : interactive shiny apps and addins for data recoding, contingency tables, dataset metadata handling, and several convenience functions.
    Mots-clés : OfficialStatistics.


  • Becquet Valentine, Nouaman Marcellin, Plazy Mélanie, Agoua Aline, Zébago Clémence, Dao Hervé, Montoyo Alice, Jary Aude, Coffie Patrick A., Eholié Serge, Larmarange Joseph et and the ANRS 12381 PRINCESSE team (2021) « A community-based healthcare package combining testing and prevention tools, including pre-exposure prophylaxis (PrEP), immediate HIV treatment, management of hepatitis B virus, and sexual and reproductive health (SRH), targeting female sex workers (FSWs) in Côte d’Ivoire: the ANRS 12381 PRINCESSE project », BMC Public Health, 21 (1) (décembre 4), p. 2214. DOI : 10.1186/s12889-021-12235-0. https://doi.org/10.1186/s12889-021-12235-0.
    Résumé : Pre-exposure prophylaxis (PrEP) is recommended by the WHO for HIV prevention among female sex workers (FSWs). A study conducted in 2016–2017 in Côte d’Ivoire showed that if PrEP is acceptable, FSWs also have many uncovered sexual health needs. Based on this evidence, the ANRS 12381 PRINCESSE project was developed in collaboration with a community-based organization. The main objective is to develop, document, and analyze a comprehensive sexual and reproductive healthcare package among FSWs in Côte d’Ivoire.
    Mots-clés : Côte d’Ivoire, HIV prevention, Mixed-methods research, Mobile clinics, Pre-exposure prophylaxis (PrEP), Sex work, Sexual and reproductive health, Sexually transmitted infections (STIs), hepatitis B.


  • Boye Sokhna, Bouaré Seydou, Ky-Zerbo Odette, Rouveau Nicolas, Simo Fotso Arlette, d'Elbée Marc, Silhol Romain, Maheu-Giroux Mathieu, Vautier Anthony, Breton Guillaume, Keita Abdelaye, Bekelynck Anne, Desclaux Alice, Larmarange Joseph et Pourette Dolorès (2021) « Challenges of HIV Self-Test Distribution for Index Testing When HIV Status Disclosure Is Low: Preliminary Results of a Qualitative Study in Bamako (Mali) as Part of the ATLAS Project », Frontiers in Public Health, 9 (mai 19). DOI : 10.3389/fpubh.2021.653543. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpubh.2021.653543/full?&utm_source=Email_to_authors_&utm_medium=Email&utm_content=T1_11.5e1_author&utm_campaign=Email_publication&field=&journalName=Frontiers_in_Public_Health&id=653543.
    Résumé : The rate of HIV status disclosure to partners is low in Mali, a West African country with a national HIV prevalence of 1.2%. HIV self-testing (HIVST) could increase testing coverage among partners of people living with HIV (PLHIV). This study aims to improve our understanding of the practices, limitations and issues related to the distribution of HIV self-tests at an HIV care clinic in Bamako, Mali. An ethnographic survey was conducted in 2019. It consisted of (i) individual interviews with 8 health professionals involved in the distribution of HIV self-tests; (ii) 591 observations of medical consultations, including social service consultations, with PLHIV; (iii) 7 observations of peer educator-led PLHIV group discussions. HIVST was discussed in only 9% of the observed consultations (51/591). When HIVST was discussed, the discussion was almost always initiated by the health professional rather than PLHIV. HIVST was discussed infrequently because in most of the consultations, it was not appropriate to propose partner HIVST (e.g., when PLHIV were widowed, did not have partners, or had delegated someone to renew their prescriptions). Some PLHIV had not disclosed their HIV status to their partners. Dispensing HIV self-tests was time-consuming, and medical consultations were very short. Three main barriers to HIV self-test distribution when HIV status had not been disclosed to partners were identified: (1) almost all health professionals avoided offering HIVST to PLHIV when they thought or knew that the PLHIV had not disclosed their HIV status to partners; (2) PLHIV were reluctant to offer HIVST to their partners if they had not disclosed their HIV-positive status to them; (3) there was limited use of strategies to support the disclosure of HIV status. In conclusion, it is essential to strengthen strategies to support the disclosure of HIV+ status. It is necessary to develop a specific approach for the provision of HIV self-tests for the partners of PLHIV by rethinking the involvement of stakeholders. This approach should provide them with training tailored to the issues related to the (non)disclosure of HIV status and gender inequalities, and improving counseling for PLHIV.
    Mots-clés : HIV self-testing, HIV status disclosure, Index testing, Knowledge of HIV status, Mali, Partners of PLHIV, People living with HIV, Screening -.


  • d'Elbée Marc, Traore Métogara Mohamed, Badiane Kéba, Vautier Anthony, Simo Fotso Arlette, Kabemba Odé Kanku, Rouveau Nicolas, Godfrey-Faussett Peter, Maheu-Giroux Mathieu, Boily Marie-Claude, Medley Graham Francis, Larmarange Joseph, Terris-Prestholt Fern et ATLAS Team (2021) « Costs and Scale-Up Costs of Integrating HIV Self-Testing Into Civil Society Organisation-Led Programmes for Key Populations in Côte d'Ivoire, Senegal, and Mali », Frontiers in Public Health, 9 (mai 24). DOI : 10.3389/fpubh.2021.653612. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpubh.2021.653612/full.
    Résumé : Despite significant progress on the proportion of individuals who know their HIV status in 2020, Côte d’Ivoire (76%), Senegal (78%), and Mali (48%) remain far below, and key populations (KP) including female sex workers (FSW), men who have sex with men (MSM), and people who use injectable drugs (PWuID) are the most vulnerable groups with a HIV prevalence at 5%-30%. HIV self-testing (HIVST), a process where a person collects his/her own specimen, performs an HIV test, and interprets the result, was introduced in 2019 as a new testing modality through the ATLAS project coordinated by the international partner organisation Solthis (IPO). In this paper, we estimate the costs of implementing HIVST through twenty-three civil society organisations (CSO)-led models for KP in Côte d’Ivoire (N=7), Senegal (N=11), and Mali (N=5). We modelled costs for programme transition (2021) and early scale-up (2022-2023). Between July 2019 and September 2020, a total of 51,028, 14,472 and 34,353 HIVST kits were distributed in Côte d’Ivoire, Senegal, and Mali, respectively. Across countries, 64%-80% of HIVST kits were distributed to FSW, 20%-31% to MSM, and 5%-8% to PWuID. Average costs per HIVST kit distributed ranged $12-$15 (FSW), $14-$27 (MSM), and $15-$143 (PWuID), driven by personnel costs at various intervention levels (53%-78% of total costs), and HIVST kits costs (2%-15%). Estimated average costs at scale-up ranged $6-$13 (FSW), $6-$23 (MSM), and $14-$50 (PWuID), and were mainly explained by the spreading of IPO costs over higher HIVST distribution volumes. In all three countries, CSO-led HIVST kit provision to KP showed relatively high costs during the study period related to the progressive integration of the programme to CSO activities and contextual challenges (COVID-19 pandemic, country safety concerns). The analysis of costs at scale suggests that, in the transition to scale-up and further integration of the HIVST programme into CSO existing activities, this model can evolve into an affordable HIV testing strategy. This is particularly relevant as it remains today the most promising strategy for reaching KP of the HIV epidemic, their sexual partners, and FSW clients not accessing HIV testing. Further research will assess the overall cost-effectiveness of this model.
    Mots-clés : Costs and Cost Analysis, Côte d'Ivoire, diagnosis, Female sex workers, HIV self-testing, Key populations, Knowledge of HIV status, Mali, Men who have sex with men, People who use injectable drugs, Scale-up, screening, Senegal, West Africa.

  • d'Elbée Marc, Traore Métogara Mohamed, Badiane Kéba, Vautier Anthony, Simo Fotso Arlette, Kanku Kabemba Odé, Rouveau Nicolas, Godfrey-Faussett Peter, Maheu-Giroux Mathieu, Boily Marie-Claude, Medley Graham Francis, Larmarange Joseph et Terris-Prestholt Fern (2021) « Costs and costs-at-scale of provision of HIV self-testing kits by civil society organisations to key populations and their sexual partners in Côte d'Ivoire, Senegal and Mali » (poster PED500), présenté à 11th IAS Conference on HIV Science, Berlin. https://theprogramme.ias2021.org/Abstract/Abstract/476.
    Résumé : BACKGROUND: Despite significant progress on the proportion of individuals who know their HIV status in 2020, Côte d'Ivoire (76%), Senegal (78%), and Mali (48%) remain far below the 90-90-90 targets. Key populations including female sex workers (FSW), men who have sex with men (MSM), and people who use drugs (PWUD) are the most vulnerable groups with HIV prevalence at 5%-30%. HIV self-testing (HIVST) was introduced in West Africa in 2019 as a new testing modality through the ATLAS project coordinated by the international partner organisation Solthis (IPO). METHODS: We estimated the costs of implementing HIVST through twenty-three civil society organisations (CSO)-led models in Côte d'Ivoire (N=7), Senegal (N=11), and Mali (N=5). We modelled costs for programme transition (2021) and early scale-up (2022-2023). RESULTS: Between July-2019 and September-2020, a total of 51,028, 14,472 and 34,353 HIVST kits were distributed in Côte d'Ivoire, Senegal, and Mali, respectively. Across countries, 64%-80% of HIVST kits were distributed to FSW, 20%-31% to MSM, and 5%-8% to PWUD. Cost per HIVST kit distributed ranged from $12-$15 (FSW), $14-$27 (MSM), to $15-$143 (PWUD), driven by personnel costs at various intervention levels (53%-78% of total costs), and HIVST kit costs (2%-15%). Predicted costs at scale-up ranged from $5-$13 (FSW), $5-$24 (MSM), to $13-$53 (PWUD), and were mainly explained by the spreading of IPO costs over higher HIVST distribution volumes. CONCLUSIONS: In all countries, CSO-led HIVST kit provision to key populations showed relatively high costs related to the progressive integration of the programme to CSO activities and contextual challenges (e.g. country security issues). In the transition to scale-up and further integration of the HIVST programme into CSO activities, this model can become less costly. This is particularly relevant as it remains today the most promising strategy for reaching key populations and their sexual partners not accessing HIV testing.


  • Fiorentino Marion, Nishimwe Marie, Protopopescu Camelia, Iwuji Collins, Okesola Nonhlanhla, Spire Bruno, Orne-Gliemann Joanna, McGrath Nuala, Pillay Deenan, Dabis François, Larmarange Joseph, Boyer Sylvie et for the ANRS 12249 TaSP Study Group (2021) « Early ART Initiation Improves HIV Status Disclosure and Social Support in People Living with HIV, Linked to Care Within a Universal Test and Treat Program in Rural South Africa (ANRS 12249 TasP Trial) », AIDS and Behavior, 25 (4) (avril), p. 1306-1322. DOI : 10.1007/s10461-020-03101-y. https://doi.org/10.1007/s10461-020-03101-y.
    Résumé : We investigated the effect of early antiretroviral treatment (ART) initiation on HIV status disclosure and social support in a cluster-randomized, treatment-as-prevention (TasP) trial in rural South Africa. Individuals identified HIV-positive after home-based testing were referred to trial clinics where they were invited to initiate ART immediately irrespective of CD4 count (intervention arm) or following national guidelines (control arm). We used Poisson mixed effects models to assess the independent effects of (a) time since baseline clinical visit, (b) trial arm, and (c) ART initiation on HIV disclosure (n = 182) and social support (n = 152) among participants with a CD4 count > 500 cells/mm3 at baseline. Disclosure and social support significantly improved over follow-up in both arms. Disclosure was higher (incidence rate ratio [95% confidence interval]: 1.24 [1.04; 1.48]), and social support increased faster (1.22 [1.02; 1.46]) in the intervention arm than in the control arm. ART initiation improved both disclosure and social support (1.50 [1.28; 1.75] and 1.34 [1.12; 1.61], respectively), a stronger effect being seen in the intervention arm for social support (1.50 [1.12; 2.01]). Besides clinical benefits, early ART initiation may also improve psychosocial outcomes. This should further encourage countries to implement universal test-and-treat strategies.


  • Inghels Maxime, Kouassi Arsène Kra, Niangoran Serge, Bekelynck Anne, Carillon Séverine, Sika Lazare, Koné Mariatou, Danel Christine, Desgrées du Loû Annabel, Larmarange Joseph et for the research team ANRS 12323 DOD-CI (2021) « Telephone peer recruitment and interviewing during a respondent-driven sampling (RDS) survey: feasibility and field experience from the first phone-based RDS survey among men who have sex with men in Côte d’Ivoire », BMC Medical Research Methodology, 21 (1) (février 5), p. 25. DOI : 10.1186/s12874-021-01208-x. https://doi.org/10.1186/s12874-021-01208-x.
    Résumé : Many respondent-driven sampling (RDS) methodologies have been employed to investigate hard-to-reach populations; however, these methodologies present some limits. We describe a minimally investigated RDS methodology in which peer recruitment and interviewing are phone-based. The feasibility of the methodology, field experiences, validity of RDS assumptions and characteristics of the sample obtained are discussed.
    Mots-clés : Côte d’Ivoire, Men who have sex with men, Phone-based survey, Respondent-driven sampling.

  • Iwuji Collins, Baisley Kathy, Orne-Gliemann Joanna, Larmarange Joseph, Plazy Mélanie, Collier Dami, Dreyer Jaco, Mngomezulu T, Herbst Kobus, Hanekom W, Dabis François et Siedner Mark (2021) « Long-term survival among people living with HIV in rural South Africa: results from 6 years of observation in the ANRS 12249 treatment as prevention trial » (poster PEC279), présenté à 11th IAS Conference on HIV Science, Berlin. https://theprogramme.ias2021.org/Abstract/Abstract/2085.
    Résumé : BACKGROUND: Universal test-and-treat trials increased population-level virological suppression across trial sites in sub-Saharan Africa. We followed the ANRS 12249 TasP trial population for 6 years to determine whether the intervention had longer-term survival benefits. METHODS: The TasP trial was a cluster-randomised trial implemented in 22 communities in rural South Africa, from 2012'2016. Households were offered six-monthly home-based HIV testing. Immediate antiretroviral therapy (ART) was offered in trial clinics to all people living with HIV (PLHIV) in the intervention clusters and according to national guidelines in the control clusters. At trial end, individuals attending the intervention clinics were transferred to the public ART programme, with a 'treat-all' strategy adopted in September 2016. Deaths during and two years after trial end were ascertained through annual demographic surveillance. Random effects Poisson regression was used to estimate rate ratios (RR) and 95%CI for the effect of trial arm on mortality among i) all PLHIV regardless of serostatus awareness, ii) PLHIV aware of their status, iii) those not on ART at entry to trial clinics. An interaction term between period and treatment arm was included, to allow the effect of trial arm to differ between periods. RESULTS: Amongst all PLHIV and those aware of their serostatus, there was no effect of immediate ART on mortality (Table). Among individuals who started ART during the trial, there was evidence that the intervention decreased mortality (aRR=0.69, 95%CI=0.45-1.04, p=0.08), although the effect was primarily during the trial (aRR=0.49, 95%CI=0.28-0.85, p=0.01), but not after the trial ended (aRR=1.15, 95%CI=0.59-2.21, p=0.69). CONCLUSIONS: The 'treat-all' strategy resulted in a mortality benefit amongst individuals who started ART within the trial but not in all PLHIV over 6 years of follow-up. To achieve maximum benefit of immediate ART in South Africa, barriers to ART uptake and retention in care need to be addressed.
  • Kouassi Arsène Kra, Simo Fotso Arlette, N'Guessan Kouassi Noël, Geoffroy Olivier, Younoussa Sidibé, Kanku Kabemba Odé, Dieng Baidy, Dama Ndeye Pauline, Rouveau Nicolas, Maheu-Giroux Mathieu, Boily Marie-Claude, Silhol Romain, d'Elbée Marc, Vautier Anthony, Larmarange Joseph et on behalf of the ATLAS Team (2021) « Reaching key and peripheral populations: a phone-based survey of HIV self-test users in West Africa » (poster #PEC004), présenté à 21st ICASA, Durban.
    Résumé : Background In West Africa, community-based strategies focussing on key populations (KP) such as female sex workers (FSW) and men having sex with men (MSM) have significantly improved access to HIV testing for KP. However, some of them (like “occasional FSW” or “hidden MSM”) remain difficult to reach, as well as their sexual partners and clients. HIV self-testing (HIVST) kits can be distributed to primary contacts for personal use and through secondary distribution, where contacts are invited to redistribute kits to their peers, partners, and relatives. Since 2019, the ATLAS program implements such a strategy in Côte d’Ivoire, Mali, and Senegal, including FSW-based and MSM-based activities within the communities. Methods To examine the profiles of actual HIVST users without actively tracking them, we implemented a phone‐based survey. Between March and June 2021, leaflets were distributed in Côte d'Ivoire, Mali and Senegal with the HIV test kits, inviting users to call a free phone number anonymously. Participation was rewarded with $3 USD of phone credit. Each flyer had a unique participation number to indirectly identify the distribution channel (DC), FSW-based or MSM-based. Results A total of 1305 participants were recruited among the FSW-DC and 1100 through MSM-DC across countries out of 44’598 HIVST kits distributed. Of participants, 69% received their self-test kit through primary distribution and 31% received it from a friend (17%), sexual partner (7%), relative (6%) or colleague (1%), which illustrates the feasibility of secondary distribution. In the FSW-DC, 48% of participants were male, and in the MSM-DC 9% were female, showing the capacity of HIVST to reach sexual partners and clients of KP. Only 50% of male participants in the MSM-DC reported to the interviewer that they ever had sex with a man, suggesting that some “hidden MSM” may also be recruited. One third of female participants from the FSW-DC and 45% of male participants from the MSM-DC were testing for the first time. The proportions whose last HIV test was done more than a year were respectively 24% and 14%. These proportions are higher than observed in surveys conducted among FSW and MSM in the same countries. Conclusions HIVST offers a complementary testing approach to increase diagnosis coverage among KP that face barriers to conventional HIV testing strategies. Secondary distribution of HIVST is feasible and has the potential to reach, beyond KP, vulnerable peripheral groups.


  • Kra Arsène Kouassi, Colin Géraldine, Diop Papa Moussa, Fotso Arlette Simo, Rouveau Nicolas, Hervé Kouakou Kouamé, Geoffroy Olivier, Diallo Bakary, Kabemba Odé Kanku, Dieng Baidy, Diallo Sanata, Vautier Anthony, Larmarange Joseph et ATLAS Team (2021) « Introducing and Implementing HIV Self-Testing in Côte d'Ivoire, Mali, and Senegal: What Can We Learn From ATLAS Project Activity Reports in the Context of the COVID-19 Crisis? », Frontiers in Public Health (juillet 20), p. 1-14. DOI : 10.3389/fpubh.2021.653565. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpubh.2021.653565/full.
    Résumé : Background: The ATLAS program promotes and implements HIVST in Côte d’Ivoire, Mali, and Senegal. Priority groups include members of key populations – female sex workers (FSW), men having sex with men (MSM), and people who use drugs (PWUD) – and their partners and relatives. HIVST distribution activities, which began in mid-2019, were impacted in early 2020 by the COVID-19 pandemic. Methods: This article, focusing only on outreach activities among key populations, analyzes quantitative and qualitative program data collected during implementation to examine temporal trends in HIVST distribution and their evolution in the context of the COVID-19 health crisis. Specifically, we investigated the impact on, the adaptation of, and the disruption of field activities. Results: In all three countries, the pre-COVID-19 period was marked by a gradual increase in HIVST distribution. The period corresponding to the initial emergency response (March-May 2020) witnessed an important disruption of activities: a total suspension in Senegal, a significant decline in Côte d’Ivoire, and a less pronounced decrease in Mali. Secondary distribution was also negatively impacted. Peer educators showed resilience and adapted by relocating from public to private areas, reducing group sizes, moving night activities to the daytime, increasing the use of social networks, integrating hygiene measures, and promoting assisted HIVST as an alternative to conventional rapid testing. From June 2020 onward, with the routine management of the COVID-19 pandemic, a catch-up phenomenon was observed with the resumption of activities in Senegal, the opening of new distribution sites, a rebound in the number of distributed HIVST kits, a resurgence in larger group activities, and a rebound in the average number of distributed HIVST kits per primary contact. Conclusions: Although imperfect, the program data provide useful information to describe changes in the implementation of HIVST outreach activities over time. The impact of the COVID-19 pandemic on HIVST distribution among key populations was visible in the monthly activity reports. Focus groups and individual interviews allowed us to document the adaptations made by peer educators, with variations across countries and populations. These adaptations demonstrate the resilience and learning capacities of peer educators and key populations.
    Mots-clés : Côte d'Ivoire, COVID-19, HIV self-testing, Key populations, Mali, Senegal, West Africa.


  • Ky-Zerbo Odette, Desclaux Alice, Kouadio Alexis Brou, Rouveau Nicolas, Vautier Anthony, Sow Souleymane, Camara Sidi Cheick, Boye Sokhna, Pourette Dolorès, Sidibé Younoussa, Maheu-Giroux Mathieu, Larmarange Joseph et on behalf of the ATLAS Team (2021) « Enthusiasm for Introducing and Integrating HIV Self-Testing but Doubts About Users: A Baseline Qualitative Analysis of Key Stakeholders' Attitudes and Perceptions in Côte d'Ivoire, Mali and Senegal », Frontiers in Public Health, 9 (octobre 18). DOI : 10.3389/fpubh.2021.653481. https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fpubh.2021.653481.
    Résumé : Since 2019, the ATLAS project, coordinated by Solthis in collaboration with national AIDS programs, has introduced, promoted and delivered HIV self-testing (HIVST) in Côte d'Ivoire, Mali and Senegal. Several delivery channels have been defined, including key populations: men who have sex with men, female sex workers and people who use injectable drugs. At project initiation, a qualitative study analyzing the perceptions and attitudes of key stakeholders regarding the introduction of HIVST in their countries and its integration with other testing strategies for key populations was conducted. The study was conducted from September to November 2019 within 3 months of the initiation of HIVST distribution. Individual interviews were conducted with 60 key informants involved in the project or in providing support and care to key populations: members of health ministries, national AIDS councils, international organizations, national and international non-governmental organizations, and peer educators. Semi structured interviews were recorded, translated when necessary, and transcribed. Data were coded using Dedoose© software for thematic analyses. We found that stakeholders' perceptions and attitudes are favorable to the introduction and integration of HIVST for several reasons. Some of these reasons are held in common, and some are specific to each key population and country. Overall, HIVST is considered able to reduce stigma; preserve anonymity and confidentiality; reach key populations that do not access testing via the usual strategies; remove spatial barriers; save time for users and providers; and empower users with autonomy and responsibility. It is non-invasive and easy to use. However, participants also fear, question and doubt users' autonomy regarding their ability to use HIVST kits correctly; to ensure quality secondary distribution; to accept a reactive test result; and to use confirmation testing and care services. For stakeholders, HIVST is considered an attractive strategy to improve access to HIV testing for key populations. Their doubts about users' capacities could be a matter for reflective communication with stakeholders and local adaptation before the implementation of HIVST in new countries. Those perceptions may reflect the West African HIV situation through the emphasis they place on the roles of HIV stigma and disclosure in HIVST efficiency.

  • Ky-Zerbo Odette, Desclaux Alice, Kouadio Brou Alexis, Rouveau Nicolas, Vautier Anthony, Sow Souleymane, Camara Cheick Sidi, Boye Sokhna, Pourette Dolorès, Younoussa Sidibé, Maheu-Giroux Mathieu, Larmarange Joseph et for the ATLAS Team (2021) « Introducing HIV self-testing (HIVST) among key populations in West Africa: a baseline qualitative analysis of key stakeholders' attitudes and perceptions in Côte d'Ivoire, Mali, and Senegal » (poster PEC320), présenté à 11th IAS Conference on HIV Science, Berlin. https://theprogramme.ias2021.org/Abstract/Abstract/972.
    Résumé : BACKGROUND: HIV self-testing (HIVST) is a way to improve HIV status knowledge and access to HIV testing. Since 2019, the ATLAS project has introduced, promoted, and delivered HIVST in Côte d'Ivoire, Mali, and Senegal, in particular among female sex workers (FSW), men who have sex with men (MSM), people who use drugs (PWUD), these key populations being particularly vulnerable to HIV and stigmatized in West Africa. Stakeholders involved in HIV testing activities targeting key populations are essential for the deployment of HIVST. Here, we analyze their perceptions of the introduction of HIVST in their countries. METHODS: A qualitative survey was conducted from September to November 2019 within three months of HIVST distribution initiation. Individual interviews were conducted with 60 stakeholders (Côte d'Ivoire, 19; Mali, 20; Senegal, 21). Semi-structured interviews were recorded, translated when necessary, and transcribed. Data were coded using Dedoose"© software for thematic analyses. RESULTS: In the three countries, stakeholders express enthusiasm and willingness to introduce HIVST for several reasons. HIVST is considered able to reduce stigma, preserve anonymity and confidentiality, especially for MSM and PWUD; reach key populations that do not access testing via usual strategies and HIV+ key populations; remove spatial barriers; save time for providers and users, notably for FSW; and empower users with autonomy and responsibility. HIVST is noninvasive and easy to use. Secondary distribution of HIVST seems appropriate for reaching partners of MSM, with confidentiality. However, stakeholders expressed doubts about key populations' ability, particularly PWUD, to correctly use HIVST kits, ensure quality secondary distribution, accept a reactive test result, and use confirmation testing and care services. They also mentioned that FSW might have difficulties redistributing HIVST to their clients and partners. CONCLUSIONS: HIVST is considered an attractive strategy to improve access to HIV testing for key populations. The doubts about users' capacities could be a matter of reflective communication with stakeholders before HIVST implementation in other western African countries.

  • Larmarange Joseph (2021) « Enseigner R sur YouTube en temps de Covid : retours d’expérience des webin-R » (communication orale), présenté à Journées d'étude : Compter, Mesurer, Calculer.. Raisonner ? Enseigner le quanti en sciences sociales dans le supérieur : pratiques et défis", Nantes. https://quanti.hypotheses.org/2157.
    Résumé : En raison du contexte sanitaire, plusieurs formations intensives sur l’analyse d’enquêtes avec R et RStudio à destination de mastorants, doctorants et post-doctorants en sciences sociales que je devais animer en France et en Afrique de l’Ouest ont dues être annulées ou reportées. En réponse, a été mis en place à partir de novembre 2019 un webinaire en ligne hebdomadaire d’enseignement à R : les webin-R. Face à la demande (plus de 400 inscrits à la mailing liste dédiée mise en place début novembre 2020), il a été choisi de diffuser le webin-R en live sur YouTube, avec possibilité de visionnage en différé. Les séances durent entre 1h30 et 2h. L’intervenant partage son écran pour tester le code R en direct et permettre aux participants de visualiser l’interface RStudio. Comme les interactions avec les participants sont limitées (uniquement le chat YouTube pendant le live), des sessions interactives du type Foire aux questions (FAQ) sont organisées sur Zoom tous les 4 à 6 séances, enregistrées et rediffusées sur YouTube. YouTube a également été choisi pour sa facilité d’utilisation, sa bande passante élevée (notamment pour les spectateurs africains) et la possibilité de visionner les vidéos dans différentes qualités (dont en HD 1080p, indispensable pour que la capture d’écran et le code R soient bien lisibles). La captation vidéo est réalisée avec le service https://streamyard.com/ qui permet un flux video live en 1080p, le suivi en direct du chat et la possibilité d’afficher à l’image des commentaires choisis par l’intervenant. Les webin-R s’accompagnent d’une mailing listes dédiée, d’une chaîne YouTube et d’un site d’accompagnement (https://larmarange.github.io/webin-R/) où pour chaque séance sont fournies des ressources additionnelles, notamment les scripts R des séances et des liens vers des chapitres analyse-R (https://larmarange.github.io/analyse-R/), une sorte de manuel pratique en ligne existant depuis une dizaine d’années (les contenus correspondent à l’équivalent d’un ouvrage de plus de 1200 pages et le site enregistre ~50 000 pages vues par mois). L’ensemble des contenus des webin-R et d’analyse-R sont accessibles gratuitement et sous licence libre Creative Commons. Les webin-R n’ont pas pour vocation d’enseigner les statistiques proprement dites mais plutôt comment réaliser des statistiques avec les logiciels R et RStudio. Ils se focalisent sur la mise en œuvre pratique, l’objectif étant de donner les clés de départ pour permettre aux participants de pouvoir continuer à s’autoformer par la suite. Au 1er mars 2021, la chaîne YouTube des webinaires totalisait 485 abonnés, 11 vidéos (9 webin-R et 2 FAQ) et 8213 vues. Selon les données analytiques des 90 derniers jours : le nombre moyen de vue par spectateur est de 4,0 et les abonnés représentent 48% des vues. Mi-février 2021, après les neuf premières séances, une enquête a été mené auprès des participants aux webin-R. Il s’agissait d’un questionnaire en ligne dont la promotion a été réalisée via la liste de diffusion : 152 questionnaires complets ont été reçus. Les répondants étaient en majorité des hommes (61%). Ils étaient âgés de 33 ans en médiane (IQR : 28-41). Les deux tiers (64%) résident en France, 31% en Afrique francophone. Ils relèvent de situations diverses : étudiant·e·s en licence (1%), mastorant·e·s (16%), doctorant·e·s (29%), post-doctorant·e·s (5%), ingénieur·e·s de recherche (15%), chercheur·e·s ou enseignant-chercheur·e·s (14%), personnes travaillant dans le secteur privé (19%). Les disciplines sont toutes aussi variées : épidémiologie (19%), sociologie (15%), démographie (14%), économie (11%), statistique (9%), géographie (6%), … En termes de participation, on observe un léger phénomène de fatigue, avec un taux de participation de 80-90% pour les premières séances et de 61-76% pour les dernières séances. Surtout, la proportion suivant les séances en direct a diminué au profit d’un suivi en différé. Parmi les points forts mentionnés par les participants : visualisation en direct de la mise en œuvre du code via l’écran partagé ; la mise à disposition des scripts et de ressources en ligne ; l’approche pratique et pragmatique ; le fait que les vidéos et les ressources soient en français ; la possibilité de revoir les vidéos en différé ; l’existence du site analyse-R en complément des vidéos (78% l’utilisent régulièrement) ; l’existence de sessions FAQ… Parmi les points faibles sont mentionnés : l’absence d’exercice ; la non-possibilité de valider des crédits d’enseignement ; le fait que toutes les explications données pendant les vidéos ne sont pas forcément reprises sur analyse-R ; le souhait de plus d’applications concrètes sur des données existantes ; un temps insuffisant consacré à l’interprétation des résultats ; une organisation et structuration des sessions FAQ à améliorer… Une enquête complémentaire est prévue en mai 2021. La présentation portera sur les leçons apprises de l’expérience des webin-R, ses atouts et ses limites.

  • Larmarange Joseph (2021) « From Key Populations to beyond : using HIV self-testing to increasingly reach vulnerable groups in West-Africa » (communication orale), présenté à 11th IAS Conference on HIV Science, Berlin. https://theprogramme.ias2021.org/Programme/Session/163.

  • Larmarange Joseph (2021) « Initier la communauté de recherche à l’analyse d’enquêtes avec R et RStudio : retours d’expériences d’analyse-R et des webin-R » (communication orale), présenté à Semaine Data SHS 2021, Paris. https://progedo.hypotheses.org/1787.

  • Larmarange Joseph, Ludecke Daniel, Wickham Hadley, Bojanowski Michal et Briatte François (2021) Labelled: Manipulating Labelled Data, version 2.9.0. https://CRAN.R-project.org/package=labelled.
    Résumé : Work with labelled data imported from 'SPSS' or 'Stata' with 'haven' or 'foreign'. This package provides useful functions to deal with "haven_labelled" and "haven_labelled_spss" classes introduced by 'haven' package.
  • Larmarange Joseph et pour l'équipe ATLAS (2021) « Au-delà des populations clés : la distribution secondaire de kits d’autodépistage du VIH en Afrique de l’Ouest » (communication orale (symposium ATLAS), présenté à 21st ICASA conference, Durban.

  • Larmarange Joseph et Sjoberg Daniel D. (2021) Broom.helpers: Helpers for Model Coefficients Tibbles, version 1.5.0. https://CRAN.R-project.org/package=broom.helpers.
    Résumé : Provides suite of functions to work with regression model 'broom::tidy()' tibbles. The suite includes functions to group regression model terms by variable, insert reference and header rows for categorical variables, add variable labels, and more.

  • Robinson David, Hayes Alex, Couch [aut Simon, Patil Indrajeet, Chiu Derek, Gomez Matthieu, Demeshev Boris, Menne Dieter, Nutter Benjamin, Johnston Luke, Bolker Ben, Briatte Francois, Arnold Jeffrey, Gabry Jonah, Selzer Luciano, Simpson Gavin, Preussner Jens, Hesselberth Jay, Wickham Hadley, Lincoln Matthew, Gasparini Alessandro, Komsta Lukasz, Novometsky Frederick, Freitas Wilson, Evans Michelle, Brunson Jason Cory, Jackson Simon, Whalley Ben, Whiting Karissa, Rosseel Yves, Kuehn Michael, Cimentada Jorge, Holgersen Erle, Werner Karl Dunkle, Christensen Ethan, Pav Steven, PJ Paul, Schneider Ben, Kennedy Patrick, Medina Lily, Fannin Brian, Muhlenkamp Jason, Lehman Matt, Denney Bill, Crane Nic, Bates Andrew, Arel-Bundock Vincent, Hayashi Hideaki, Tobalina Luis, Wang Annie, Tham Wei Yang, Wang Clara, Smith Abby, Cooper Jasper, Krauska E. Auden, Wang Alex, Barrett Malcolm, Gray Charles, Wilber Jared, Gegzna Vilmantas, Szocs Eduard, Aust Frederik, Moore Angus, Williams Nick, Barth Marius, Wundervald Bruna, Cahoon Joyce, McDermott Grant, Zarca Kevin, Kuriwaki Shiro, Wallrich Lukas, Martherus James, Xiao Chuliang, Larmarange Joseph, Kuhn Max, Bojanowski Michal, Malmedal Hakon, Wang Clara, Oller Sergio, Sonnet Luke, Hester Jim, Brunson Cory, Schneider Ben, Gray Bernie, Averick Mara, Jacobs Aaron, Bender Andreas, Templer Sven, Buerkner Paul-Christian, Kay Matthew, Pennec Erwan Le, Junkka Johan, Zhu Hao, Soltoff Benjamin, Saldana Zoe Wilkinson, Littlefield Tyler, Gray Charles T., Banks Shabbh E., Robinson Serina, Bivand Roger, Ots Riinu, Williams Nicholas, Jakobsen Nina, Weylandt Michael, Lendway Lisa, Hailperin Karl, Rodriguez Josue, Bryan Jenny, Jarvis Chris, Macfarlane Greg, Mannakee Brian, Tyre Drew, Singh Shreyas, Geffert Laurens, Ooi Hong, Bengtsson Henrik, Szocs Eduard, Hugh-Jones David, Stigler Matthieu, Tavares Hugo, Vervoort R. Willem, Wiernik Brenton M., Yamamoto Josh, Lee Jasme et Sanders Taren (2021) Broom: Convert Statistical Objects into Tidy Tibbles, version 0.7.10. https://CRAN.R-project.org/package=broom.
    Résumé : Summarizes key information about statistical objects in tidy tibbles. This makes it easy to report results, create plots and consistently work with large numbers of models at once. Broom provides three verbs that each provide different types of information about a model. tidy() summarizes information about model components such as coefficients of a regression. glance() reports information about an entire model, such as goodness of fit measures like AIC and BIC. augment() adds information about individual observations to a dataset, such as fitted values or influence measures.


  • Rouveau Nicolas, Ky-Zerbo Odette, Boye Sokhna, Fotso Arlette Simo, d’Elbée Marc, Maheu-Giroux Mathieu, Silhol Romain, Kouassi Arsène Kra, Vautier Anthony, Doumenc-Aïdara Clémence, Breton Guillaume, Keita Abdelaye, Ehui Eboi, Ndour Cheikh Tidiane, Boilly Marie-Claude, Terris-Prestholt Fern, Pourette Dolorès, Desclaux Alice, Larmarange Joseph et ATLAS Team (2021) « Describing, analysing and understanding the effects of the introduction of HIV self-testing in West Africa through the ATLAS programme in Côte d’Ivoire, Mali and Senegal », BMC Public Health, 21 (1) (janvier 21), p. 181. DOI : 10.1186/s12889-021-10212-1. https://doi.org/10.1186/s12889-021-10212-1.
    Résumé : Authors Nicolas Rouveau, Odette Ky-Zerbo, Sokhna Boye, Arlette Simo Fotso, Marc d’Elbée, Mathieu Maheu-Giroux, Romain Silhol, Arsène Kra Kouassi, Anthony Vautier, Clémence Doumenc-Aïdara, Guillaume Breton, Abdelaye Keita, Eboi Ehui, Cheikh Tidiane Ndour, Marie-Claude Boilly, Fern Terris-Prestholt, Dolorès Pourette, Alice Desclaux, Joseph Larmarange & for the ATLAS Team Abstract Background The ATLAS programme aims to promote and implement HIV self-testing (HIVST) in three West African countries: Côte d’Ivoire, Mali, and Senegal. During 2019–2021, in close collaboration with the national AIDS implementing partners and communities, ATLAS plans to distribute 500,000 HIVST kits through eight delivery channels, combining facility-based, community-based strategies, primary and secondary distribution of HIVST. Considering the characteristics of West African HIV epidemics, the targets of the ATLAS programme are hard-to-reach populations: key populations (female sex workers, men who have sex with men, and drug users), their clients or sexual partners, partners of people living with HIV and patients diagnosed with sexually transmitted infections and their partners. The ATLAS programme includes research support implementation to generate evidence for HIVST scale-up in West Africa. The main objective is to describe, analyse and understand the social, health, epidemiological effects and cost-effectiveness of HIVST introduction in Côte d’Ivoire, Mali and Senegal to improve the overall HIV testing strategy (accessibility, efficacy, ethics). Methods ATLAS research is organised into five multidisciplinary workpackages (WPs): Key Populations WP: qualitative surveys (individual in-depth interviews, focus group discussions) conducted with key actors, key populations, and HIVST users. Index testing WP: ethnographic observation of three HIV care services introducing HIVST for partner testing. Coupons survey WP: an anonymous telephone survey of HIVST users. Cost study WP: incremental economic cost analysis of each delivery model using a top-down costing with programmatic data, complemented by a bottom-up costing of a representative sample of HIVST distribution sites, and a time-motion study for health professionals providing HIVST. Modelling WP: Adaptation, parameterisation and calibration of a dynamic compartmental model that considers the varied populations targeted by the ATLAS programme and the different testing modalities and strategies. Discussion ATLAS is the first comprehensive study on HIV self-testing in West Africa. The ATLAS programme focuses particularly on the secondary distribution of HIVST. This protocol was approved by three national ethic committees and the WHO’s Ethical Research Committee.
    Mots-clés : Côte d’Ivoire, HIV self-testing, HIV/AIDS, Mali, Senegal, West Africa.

  • Schloerke Barret, Cook Di, Larmarange Joseph, Briatte Francois, Marbach Moritz, Thoen Edwin, Elberg Amos, Toomet Ott, Crowley Jason, Hofmann Heike et Wickham Hadley (2021) GGally: Extension to 'ggplot2', version 2.1.2. https://CRAN.R-project.org/package=GGally.
    Résumé : The R package 'ggplot2' is a plotting system based on the grammar of graphics. 'GGally' extends 'ggplot2' by adding several functions to reduce the complexity of combining geometric objects with transformed data. Some of these functions include a pairwise plot matrix, a two group pairwise plot matrix, a parallel coordinates plot, a survival plot, and several functions to plot networks.
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